מערכת החינוך העל-יסודי מופעלת חלקה בניהול העירייה וחלקה על ידי רשתות חינוך שזכו במכרז שפרסמה העירייה. משרד החינוך מכיר בניהול המוסדות בידי הרשתות ואף מתקצב אותן, בהתאם למספר התלמידים ופרמטרים אחרים.
העיתון הכלכלי 'דה-מרקר' פרסם היום כתבה מקיפה של ליאור דטל על בדיקה שערך משרד החינוך באשר להישגים הלימודיים ברשתות החינוך הפרטיות, המפעילות מאות תיכונים ברחבי הארץ (בדגש על הפריפריה) ומתוקצבות במיליארדי שקלים בשנה מתקציב משרד החינוך.
הבדיקה התמקדה בשש רשתות החינוך הגדולות במדינה; אורט, עמל, אמי"ת, בני עקיבא, עתיד ודרכא. משרד החינוך הינחה בימים אלה את הרשתות המקומיות לערוך בתוך שנתיים מכרזים חדשים להפעלת כל בתי הספר התיכוניים שבתחומם המנוהלים כיום בידי הרשתות הפרטיות. המשרד הינחה את הרשויות המקומיות לבסס את המכרזים החדשים על הנתונים שהציג כעת בכל הקשור להיקף הזכאות לבגרות, היקף נשירת תלמידים, היקף ההצטיינות בבחינות הבגרות, שיעור הלומדים חמש יחידות במתימטיקה ובאנגלית וכן האקלים הבית-ספרי.
בחינוך הדתי העל-יסודי בפ"ת החלוקה היא שאולפנות ישורון, רעות והחדשה בהדר-גנים מנוהלות בידי מרכז ישיבות ואולפנות בני עקיבא, בעוד המוסדות של הבנים: ישיבת כפר גנים וכן ישיבת אלירז – מנוהלות בידי רשת אמי"ת. נוסף עליהן יש את הרשתות הפרטיות 'דרכי נועם' המפעילה ישיבה תיכונית ואולפנא וכך גם רשת 'צביה' שעושה כן ביחס לישיבת צביה (שעד לפני 4 שנים הייתה ישיבת למרחב), בעוד ת"ת יסודי בנים, יסודי בנות והאולפנא - מנוהלות ע"י עמותת למרחב.

דיעי
ב'גדול', מנכ"ל משרד החינוך, שמואל אבואב אמר כי התברר שאין יתרון מובהק להפעלת בית ספר על ידי רשתות חינוך בבעלות פרטית על פני ניהולה בידי הרשות המקומית.
ב'שורה הראשונה' של הבדיקה, במודל האיכות שפיתח המשרד, המשקלל את שיעור הזכאים לבגרות, שיעור המצטיינים הלומדים 5 יחידות באנגלית ומתמטיקה, המאבק בנשירת תלמידים וטוהר הבחינות במבחני הבגרות, יצאה רשת דרכא (נוסדה לפני מספר שנים בידי קרן רש"י, מפעילה 25 מוסדות חינוך ומופעלת ע"י תרומות), שניה – רשת אמי"ת, שלישי – רשת אורט, רביעי – רשת עתיד ובמקום החמישי – רשת עמל.
אגב, שר החינוך בנט הכריז כידוע כי לימודי המתמטיקה מאוד חשובים. אז בדירוג מספר הלומדים חמש יחידות הן במתמטיקה והן באנגלית יצאה רשת מרכז ישיבות ואולפנות בני עקיבא במקום ה...אחרון. צדקה תתחיל בבית, לא?
הנה התמונה על מה שקורה בפתח תקווה.

מ"מ ראש העיר והממונה על החינוך הדתי, איציק דעי אמר ל'פיתה', בהתייחס לנתונים שפורסמו (מוסדות דרכי נועם בלטו בראש הרשימה המשוקללת של התיכונים המובילים בישראל, בהתבסס על שיעורי נשירה נמוכים והישגי למידה גבוהים. אולפנת דרכי נועם הובילה את הטבלה עם 772 נקודות, ישיבת דרכי נועם שנייה עם 754 נקודות, אולפנת למרחב רביעית עם 737 נקודות) כי "אנחנו גאים בכל בתי הספר שלנו ובטח בתור מי שניהל את האגף החינוך מוכר שאינו רשמי, אני גאה בהישגים שלהם".
 

	בית הספר	יישוב	שיעור הזכאים לבגרות	שיעור המצטיינים	שיעור הנשירה
1	תיכון ע"ש גולדה מאיר	פתח תקווה	99.49	7.96	0
2	שש שנתי אחד העם	פתח תקווה	97.89	13.73	0.28
3	ישיבת דרכי נעם	פתח תקווה	97.83	19.57	0
4	אולפנית ישורון	פתח תקווה	95.98	23.62	0
5	אולפנת למרחב	פתח תקווה	95.56	17.78	0
6	תיכון ברנר	פתח תקווה	92.21	6.97	0.12
7	אולפנת דרכי נעם	פתח תקווה	91.23	33.33	0
8	עמל טכנאים והנדסאים	פתח תקווה	90.78	14.08	0.15
9	עירוני ע"ש בן גוריון	פתח תקווה	88.49	12.30	0
10	ישיבת כפר גנים	פתח תקווה	86.36	13.64	0